Beberapa Prestasi yang Berhasil MAN 2 HALUT raih diantaranya :
- Juara I Matematika Ksm Tingkat Provinsi Malut
- Juara I Kimia Ksm Tingkat Provinsi Malut
- Juara I Matematika Ksm Tingkat Kabupaten
- Juara Ii Biologi Tingkat Kabupaten
- Juara Ii Kimia Tingkat Kabupaten
- Juara Iii Geografi Tingkat Kabupaten
- Juara 1 Pertandingan Bola Kaki Kkli Iain Ternate 2017
- Juara 1 Lomba Lari Maraton Tingkat Kecamatan 2016
- juara ksm fisika tingkat provinsi tahun 2022
- Juara 2 Kaligrafi Ppi (Pekan Perkemahan Islam) Semaluku Utara Tahun 2015
- Juara 4 Lomba Volley Putri Tingkat Kecamatan Tahun 2016
- Juara 1 Lomba Lkbb Tingkat Kabupaten Pekan Perkemahan Islam Kwartir Cabang Halamahera Utara 2020
- Juara Umum Ke-3 Pekan Perkemahan Hab Di Sofifi Tahun 2018
- Perwakilan 2 Siswa Atas Nama : Andriyanto Muksin Dan Harianto Abubakar Mengikuti Seleksi Timnas Usia 18 Zona Maluku Utara 2021